Kada su prošla vremena poganstva, kada je kršćanstvo prestalo biti proganjano i postalo priznato kao svjetska religija, činilo se da sve razlike treba razriješiti. Ali ponekad su samo ekumenski sabori mogli riješiti nastajuće sukobe, pobiti heretička učenja - nije bilo mira čak ni unutar Crkve.
Prvi ekumenski sabor bio je sabor u Nikeji, sazvan 325. godine. Razlog tome bilo je rašireno učenje aleksandrijskog prezbitera Arija. Njegova je bit bila negiranje identiteta između Boga Oca i Boga Sina. Tvrdio je da je Isusa Krista stvorio Gospodin, ali da nije njegovo utjelovljenje. Takva je ideja iz temelja opovrgla sve dogme kršćanstva, te je stoga u početku Arijevo učenje odbacilo Mjesni sabor. Međutim, ponosni prezbiter odbio je priznati odluku Koncila legitimnom i nastavio je pridobivati vjernike.
Tada je car Konstantin pozvao biskupe iz cijelog svijeta na Ekumenski sabor u mali grad Nicea (danas se zove Iznik i nalazi se na teritoriju moderne Turske). Neki od prisutnih predstavnika Crkve na tijelu su imali tragove mučenja,primio u ime pravog kršćanstva. Biskupi koji podržavaju Arija također su bili prisutni.
Rasprava je trajala više od dva mjeseca. Tijekom tog vremena bilo je mnogo rasprava, govora filozofa, pojašnjenja teoloških formulacija. Kako legenda kaže, manifestacija božanskog čuda stala je na kraj svađi. Kao jedinstvo triju principa dao je primjer glinene krhotine: voda, vatra, glina daju jedinstvenu cjelinu. Isto tako, Sveto Trojstvo je u biti jedan Bog. Nakon njegovog govora iz krhotine se pojavila vatra, pojavila se voda i nastala je glina. Nakon takvog čuda, Nicejski sabor je konačno odbacio Arijevo lažno učenje, izopćio ga iz Crkve, odobrio Vjerovanje i uspostavio 20 pravila crkvene discipline, odredio datum za proslavu Uskrsa.
Ali ovo Crkveno vijeće nije stalo na kraj ovom pitanju. Polemika se nastavila jako dugo. Čak se i sada još uvijek čuje njihov odjek - arijanstvo je bilo temelj učenja Jehovinih svjedoka.
Pored koncila iz 325. godine, postojao je i Drugi sabor u Nikeji, koji je sazvala carigradska Irena 787. godine. Njegova je svrha bila ukinuti ikonoklazam koji je postojao u to vrijeme. Zapravo, carica je dvaput pokušala sazvati ekumenski sabor. No 786. godine stražari koji su podržavali ikonoklaste upali su u Hram svetih apostola u Carigradu, gdje je Koncil započeo s radom. Sveti oci su se morali razići.
Pribjegavši znatnim trikovima, raspuštanju stare garde, regrutiranju novih trupa, Irina je ipak sazvala Katedralu u787., ali ga je iz Carigrada premjestio u Nikeju. Njegov rad je trajao mjesec dana, nakon njegovih rezultata, obnovljeno je štovanje ikona, dopušteno ih je u crkvama.
Međutim, ni ovaj sabor u Niceji nije uspio u potpunosti postići svoj cilj. Ikonoklazam je nastavio postojati. Ikonoklastski pokret je konačno poražen tek 843. godine na Carigradskom saboru.