Veliki japanski otoci čine četiri velika otoka - Honshu, Hokkaido, Skoku i Kyushu. Na jugu njihov nastavak je arhipelag Ryukyu. Male su skupine otoka i na istoku i na zapadu zemlje. Japanski otoci protežu se na ogromnoj udaljenosti (oko 370 tisuća četvornih kilometara). Njihova priroda kombinira otočne i kontinentalne značajke svojstvene područjima susjedne Kine, kao i specifične japanske.
Otoke Japana karakterizira jaka seizmičnost u kombinaciji s vulkanskom aktivnošću. Vulkanizam je posebno karakterističan na onim mjestima gdje prolaze konture dubokih rasjeda: zapadni rub otoka i srednji dio Honshua. U Japanu postoji samo 150 vulkana. Od toga je samo 15 aktivnih.
Otok Honshu
Mnogi ga poznaju u vezi s tužnim događajima - atomskim bombardiranjem Hirošime. No, osim tužne baštine, otok ima što ponuditi turistima. Honshu je dom izvrsne keramike, tihih planinskih sela i vrevegradska područja.
Obalne regije Hirošima i Okayama poznate su po svojim muzejima (Kurashiki), oružarima i lončarima (Bizen). Prefektura Shimonoseki poznata je po uvijek svježim morskim plodovima, posebno ribi napuhanoj, koja se u Japanu smatra delikatesom.
Industrijsko središte zemlje - Nagoya - također se nalazi na otoku Honshu. Kanazawa je poznata po svojim prekrasnim ulicama u kojima su živjeli samuraji i gejše. Takayama uvijek oduševljava ukusnom nacionalnom kuhinjom, a sela u planinama Gokayama i Shirakawa - kuće u tradicionalnom japanskom stilu, na popisu UNESCO-a.
Sjeverni dio otoka Honshu gotovo nikad ne posjećuju turisti, iako se ovdje ima što vidjeti: pobješnjele rijeke, topli izvori, stjenovite planine i uspavani vulkani.
Otok Hokaido
Ovaj otok u Japanu posljednja je granica zemlje. Malo se Japanaca i turista usuđuje putovati ovako daleko. I uzalud, jer postoji nevjerojatna priroda i beskrajna prostranstva. Otok je podijeljen u četiri glavne regije: južna, središnja, sjeverna i istočna.
Otok Kyushu
Najinternacionalnija regija u zemlji - otok Kyushu - postala je prva regija koja je usvojila nove tradicije vanjskog svijeta nakon pada samurajskih običaja. Danas su japanski otoci okrenuti prema zapadu i dalje vodeći u trgovini i umjetnosti.
Otok Shikoku
Ovaj otok je najmanji po površini i broju stanovnika. Shikoku se naziva i otokom i regijom,uključujući susjedne male japanske otoke.
Okinawa prefektura zaslužuje posebnu pažnju, koja spaja mnoge male otoke. Ima ih oko 120, neki od njih su još nenaseljeni. Veći dio otoka zauzimaju hoteli, trgovine sa suvenirima i ostalim stvarima koje bi mogle zanimati turiste.
Japanski otoci su već dugo naseljeni. Sada je država podijeljena na 8 glavnih regija s prefekturama i općinama. Sve se regije međusobno razlikuju po prirodi, kulturi, znamenitostima, pa čak i jezičnim dijalektima. Ova značajka zemlje objašnjava se činjenicom da su se otoci Japana protezali duž nekoliko klimatskih zona.